Tous les pays musulmans ne sont pas gouvernés par une théocratie, surtout depuis l'abolition du califat par Atatürk. Aujourd'hui, c'est principalement l'Arabie Séoudite qui est constituée en théocratie, avec le Coran pour constitution. Il y a eu l'Iran de Khomeiny mais la situation a changé depuis sa mort. Cependant, la plupart des pays à majorité musulmane ont l'islam pour religion d'Etat et la charia (loi islamique) comme fondement du droit. Il s'agit donc d'Etats confessionnels où seuls les musulmans ont la plénitude des droits attachés à leur nationalité. Il s'agit donc de systèmes inégalitaires. L'Etat doit être musulman, c'est pourquoi l'islam ignore la notion de laïcité telle que nous l'avons conçue, c'est-à-dire comprise comme la distinction entre les pouvoirs temporel et spirituel. Les écoles les plus fondamentalistes telles que celle des Frères musulmans considèrent, en effet, que l'islam est un tout, à la fois religion, société et Etat. Pour beaucoup de musulmans, la laïcité est synonyme d'athéisme et de rejet de Dieu de la cité. C'est ce que dit, entre autres, Tariq Ramadan. Ils ne se sentent donc pas concernés par notre modèle d'organisation publique.